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PCR产物测序



英维谱PCR产物测序基于边合成边纳米孔测序(NSS)的技术,一次性对大量PCR产物并行测序,利用生物信息学分析,对数据进行序列组装、比对并获得PCR产物的完整序列信息及突变信息。相比于传统的Sanger测序方法,我们的PCR产物测序不需要合成引物,为客户提供 “一条 read 测全长、单碱基定突变、收到样本后次日出报告” 的三代测序解决方案。

产品对比

对比维度一代测序英维谱三代测序
数据质量准确率99.99%,但遇到混合样本或者突变样本(杂合SNP、杂合indel)出现数据质量降级,表现为双峰或者乱峰单 read Q30(99.9%)+一致性 99.99%,一次读准突变
读长覆盖单次反应有效长度0.8-1kb,长片段必须分段克隆或设计walking引物,拼接耗时且易引入拼接错误一次测通,无论 0.5 kb 还是 5 kb
模板兼容性高 GC、发卡结构、重复会导致峰图衰减或双峰无引物结合区,高 GC、发卡、重复、双峰模板统统可读,盲区极少
定量能力无引物结合区,高 GC、发卡、重复、双峰模板统统可读,盲区极少可根据测序深度计算等位基因频率
实验流程需要提供测序引物,只能检测测序引物间的片段序列无需提供或设计引物,只需提供样品
交付周期2–3 kb 的扩增子全长最快需要3–5 天,片段越长,需要的周期越久不论片段大小,收到样本后次日交付结果

业务流程

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结果案例

目标序列双向引物区覆盖完整,零盲区

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长片段一次测通,
无需设计walking引物

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双峰模板照样拆解,序列各自分明

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样本要求

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